157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4149 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 509 aa  974    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  33.88 
 
 		 532 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.52 
 
 		 534 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  50.3 
 
 		 549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.93 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  43.98 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.03 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  42.26 
 
 		 557 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  27.85 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.94 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  40.64 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 549 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.32 
 
 		 555 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.15 
 
 		 523 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  45.83 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  32.99 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.16 
 
 		 500 aa  87  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  39.57 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.16 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.97 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.05 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  42.26 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  40 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  40 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 235 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  37.9 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.82 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  32.6 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  41.67 
 
 		 535 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 403 aa  67  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  46.51 
 
 		 519 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.58 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  34.51 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.13 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.13 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  32.48 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.13 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.13 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.13 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.13 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.34 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  24.91 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.63 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.43 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  40.74 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.14 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  37.59 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.45 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 553 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.15 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.42 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  39.47 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.3 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  33.87 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  37.65 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  30.88 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  38.56 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.8 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 416 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.26 
 
 		 637 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  29.01 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.43 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  30.3 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  35.37 
 
 		 562 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  37.63 
 
 		 639 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.86 
 
 		 515 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 531 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  42.03 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40.5 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 405 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  39.53 
 
 		 627 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>