230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1795 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 519 aa  1020    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  57.68 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.67 
 
 		 501 aa  180  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.56 
 
 		 486 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.92 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  40.8 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  30.3 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  36.15 
 
 		 598 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.31 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.2 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.99 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  30.95 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.73 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  30 
 
 		 596 aa  93.6  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 586 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  28.92 
 
 		 575 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.59 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 546 aa  87.4  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.61 
 
 		 480 aa  87  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.52 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.9 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.34 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  31.54 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  32.49 
 
 		 531 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  27.22 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  29.58 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  26.14 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  23.89 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  32.29 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  31.67 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.4 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  39.62 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.18 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  26.91 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.67 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.19 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  41.18 
 
 		 413 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.38 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.38 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.35 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.28 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  30.13 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  40.4 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.94 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  31.67 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  44.16 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  30.34 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  44.87 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  27.24 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.67 
 
 		 486 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  43.01 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  28.53 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  29.32 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.75 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  29.83 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  32.04 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.98 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  25.79 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.67 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 486 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  31.71 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 600 aa  57  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  38.96 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.08 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.19 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  38.96 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  38.96 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  29.22 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>