258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0042 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  905    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  83.96 
 
 
454 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  73.84 
 
 
429 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  73.84 
 
 
429 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  73.84 
 
 
429 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.37 
 
 
445 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  36.46 
 
 
483 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.58 
 
 
535 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  44.68 
 
 
478 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 
485 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.75 
 
 
491 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.62 
 
 
480 aa  87  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  41.41 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.41 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  27.54 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  24.89 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.91 
 
 
598 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
552 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.75 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  41.23 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  32.89 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.2 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  38.26 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.75 
 
 
520 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.67 
 
 
519 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.9 
 
 
514 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  36.8 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.29 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  39.5 
 
 
561 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  34.57 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.95 
 
 
596 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
586 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  23.38 
 
 
537 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
564 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 
509 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.64 
 
 
525 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.67 
 
 
565 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  29.46 
 
 
413 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  31.13 
 
 
536 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  33.02 
 
 
515 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  41.54 
 
 
619 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  23.31 
 
 
542 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  31.58 
 
 
566 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.17 
 
 
236 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.18 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  31.41 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  31.2 
 
 
425 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  31.41 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  31.41 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  46.55 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  32.57 
 
 
681 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.33 
 
 
515 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.38 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
535 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 
616 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
563 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 
665 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.04 
 
 
705 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 
481 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
546 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 
371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  31.17 
 
 
536 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  44 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 
637 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  34.84 
 
 
456 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  32.09 
 
 
371 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
659 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  40 
 
 
515 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  41.27 
 
 
473 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.75 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  40.85 
 
 
511 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  39.51 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  40 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
235 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  40 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  38.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  32.06 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  35.14 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.14 
 
 
492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  40.58 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 
739 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>