159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1307 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 491 aa  927    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  37.09 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  34.19 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  34.52 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.27 
 
 		 501 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.01 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  45.81 
 
 		 598 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.99 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.86 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.43 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.19 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.77 
 
 		 555 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.48 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.85 
 
 		 459 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.96 
 
 		 480 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.9 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.05 
 
 		 520 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  27.47 
 
 		 512 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  28.38 
 
 		 543 aa  90.1  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.6 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 558 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 552 aa  86.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.75 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.04 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  29.03 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  44.2 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  31.16 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  45.68 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  42.38 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.22 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  44.44 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  40.21 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  18.92 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.43 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  32.14 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.43 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.43 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  27.08 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  39.36 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.96 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  40.78 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  34.53 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  27.44 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.12 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.42 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  29.67 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.71 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.06 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  28.91 
 
 		 542 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 542 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 542 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  35.48 
 
 		 515 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.9 
 
 		 525 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.51 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.51 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  35.25 
 
 		 705 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.03 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 555 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 659 aa  53.5  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 412 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 609 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  32 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  29.67 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  27.56 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.01 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  45.9 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  40 
 
 		 650 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>