209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3662 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 481 aa  903    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  60.58 
 
 		 486 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  49.9 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  40.16 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  42.91 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.69 
 
 		 501 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 		 598 aa  167  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  37.38 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  33.33 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.83 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.43 
 
 		 565 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.95 
 
 		 504 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.1 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  29.45 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 558 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.9 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.28 
 
 		 487 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28.94 
 
 		 512 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.45 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.82 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  36.13 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  40.37 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.93 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.14 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.68 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.89 
 
 		 555 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.23 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.06 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  40.18 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.18 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  42.2 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  26.59 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  33.14 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 552 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  23.98 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.91 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  35.2 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.54 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  30.9 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  30.64 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 546 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  29.35 
 
 		 557 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.62 
 
 		 555 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.92 
 
 		 459 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 536 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  37.11 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  43.59 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  47.76 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  44.74 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  47.76 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  47.76 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  47.76 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.79 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.7 
 
 		 585 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  33.07 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  27.36 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  35.88 
 
 		 705 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  42.67 
 
 		 411 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 236 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  34.16 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  34.81 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.06 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.25 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.77 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.35 
 
 		 665 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  40.57 
 
 		 458 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  37.84 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.78 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  28.87 
 
 		 542 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  33.03 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 542 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>