162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4185 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 392 aa  741    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 464 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  43.6 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  44.99 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  37.96 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  42.14 
 
 		 495 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  39.8 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  42.16 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  42.28 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  39.36 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  38.27 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  41.39 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 414 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  38.2 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  36.51 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.53 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  36.99 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  35.19 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  34.26 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  33.86 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  55.15 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.96 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.93 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.95 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.85 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32.46 
 
 		 515 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  53.33 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  44.74 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  31.85 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.1 
 
 		 648 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  34.18 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  44.07 
 
 		 525 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.44 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  37.9 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 493 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 558 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  26.68 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  46.55 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 600 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  32.93 
 
 		 602 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  46.3 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  49.09 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  28.61 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.82 
 
 		 739 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  41.82 
 
 		 616 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.79 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.46 
 
 		 540 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.89 
 
 		 485 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.15 
 
 		 740 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 520 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 637 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  38.96 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  44.64 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  34.81 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5170  transcriptional regulator, CdaR  35.79 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  42.37 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  37.21 
 
 		 650 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  41.27 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 659 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.66 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  39.68 
 
 		 562 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36.71 
 
 		 525 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.71 
 
 		 525 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 601 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>