88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0936 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  46.7 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  46.41 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  44.27 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  45.45 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  34.52 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  34.01 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  35.13 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  33.25 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  31.27 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  31.87 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  31.02 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  28.06 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 425 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.54 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  31.1 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  29.78 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  31.2 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  29.45 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  26.75 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  47.17 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.83 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  28.93 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  28.46 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  28.76 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  26.05 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.13 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.75 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  29.86 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.17 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.17 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.17 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.79 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  26.53 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  34.81 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  45.21 
 
 		 485 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  36.46 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  33 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  22.01 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  26.43 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  35.14 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  31.1 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  40.51 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.76 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  36.45 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  25.57 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  31.13 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  32.5 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  31.69 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  33.94 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  28.97 
 
 		 562 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.33 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33.68 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  35.54 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  28.66 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 659 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  37.65 
 
 		 522 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  44.44 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  36.08 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 558 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  31.21 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.75 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.28 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>