129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8813 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 417 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  60.73 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  55.27 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  55.64 
 
 		 399 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  50.76 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  44.39 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  41.53 
 
 		 411 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  42.28 
 
 		 447 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  43.6 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  37.29 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  36.41 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  36.71 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  32.99 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  35.03 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  36.34 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  34.46 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  31.27 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.64 
 
 		 458 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  29.32 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  30.47 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  51.03 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.92 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  29.38 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40.56 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  51.61 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  51.61 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  51.61 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  25.07 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  52.46 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  34.01 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  26.4 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.58 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  25.92 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  28.64 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  43.94 
 
 		 538 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  25.95 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.12 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 403 aa  53.5  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.22 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  28.74 
 
 		 553 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.58 
 
 		 557 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 562 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  28.31 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 514 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 365 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 558 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  36 
 
 		 614 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  37.97 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.33 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.69 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  41.89 
 
 		 529 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  31.13 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  26 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  33.55 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 528 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  29.12 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  27.08 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.37 
 
 		 485 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.18 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.56 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  39.29 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 547 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  36.62 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  28.75 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  46.3 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  45.45 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35.8 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  43.64 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  28.16 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  42.37 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>