157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3032 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 399 aa  772    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  55.3 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  52.49 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  53.14 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  45.69 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  33.25 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  31.98 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  31.44 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  31.04 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  32.05 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  28.84 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.35 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  34.34 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  28.14 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.88 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  44.09 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  45.21 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  43 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27.73 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  38.85 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  28.94 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  33.7 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.59 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 493 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  28.88 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  29.32 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 665 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  35.82 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  47.62 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.55 
 
 		 501 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  25.88 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  28.53 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  31.01 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  24.8 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  29.77 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  40.28 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  43.9 
 
 		 553 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 518 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  26.81 
 
 		 515 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.91 
 
 		 492 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  41.56 
 
 		 645 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.43 
 
 		 542 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  24.68 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  30.91 
 
 		 502 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.91 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  24.87 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  41.67 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.81 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  35.06 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.46 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.79 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 		 528 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  29.31 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.96 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  38.36 
 
 		 648 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  40.62 
 
 		 412 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.62 
 
 		 412 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  27.04 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 561 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  38.03 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  30.5 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  38.96 
 
 		 644 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  42.25 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.02 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>