107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4926 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 395 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  51.36 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  43.68 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  40.25 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  41.81 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  40.53 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  30.26 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  27.85 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  57.14 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  28.5 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  29.34 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  48.48 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  30.09 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  37.31 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  37.31 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  37.31 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  43.28 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  26.6 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.98 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  47.62 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  52.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 553 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  34.44 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  34.44 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  34.44 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  44.12 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  36.48 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  36.48 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  36.48 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  38.81 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  43.86 
 
 		 741 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  32.95 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 558 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  41.79 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  33.16 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  39.68 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  36.51 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  43.08 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  31.21 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 532 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  19.79 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.27 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  51.02 
 
 		 512 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.91 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  44.64 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 552 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.75 
 
 		 480 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  34.76 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  46.81 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  38.46 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  42.42 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  39.68 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  42.59 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  28.54 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 609 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  44.9 
 
 		 705 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.23 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  53.33 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  39.06 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.76 
 
 		 525 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.38 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  31.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 537 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  42.11 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 478 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>