135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2465 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  847    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  92.72 
 
 		 414 aa  747    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  54.16 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  54.04 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.21 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  55.06 
 
 		 397 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50.66 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  53.97 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  48.04 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  52.79 
 
 		 384 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  51.29 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  48.86 
 
 		 421 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.61 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  48.89 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  47.53 
 
 		 420 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  43.92 
 
 		 386 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  48.82 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  43.95 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  48.54 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  44.33 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.12 
 
 		 393 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  44.85 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  40.15 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  37.81 
 
 		 539 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.07 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.49 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.78 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  40.96 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.87 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.6 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  43.66 
 
 		 276 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  44.66 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  40.95 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 563 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  35.34 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  27.85 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  40.7 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 526 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  47.37 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  32.32 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  39.22 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.33 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  54.55 
 
 		 454 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  50 
 
 		 459 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.35 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  29.06 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  27.92 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.12 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  29.06 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  53.85 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 553 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.86 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  34.74 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  23.11 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 564 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  45 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  32.84 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  39.58 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.21 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  41.79 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1136  transcriptional regulator, CdaR  24.63 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  28.83 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  37.29 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  37.29 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  28.46 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36.62 
 
 		 705 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 644 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25.75 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.21 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 637 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 554 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  37.14 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  19.66 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 552 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  46.48 
 
 		 519 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  19.66 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.39 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 659 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  45.28 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  34.91 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>