227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  100 
 
 
413 aa  795    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  74.04 
 
 
393 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  52.82 
 
 
429 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  50.36 
 
 
418 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  51.81 
 
 
428 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  51.96 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  52.07 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  52.07 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  51.43 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  52.07 
 
 
428 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  50.26 
 
 
393 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 
386 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  51.49 
 
 
429 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  48.85 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.77 
 
 
421 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  45.95 
 
 
414 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  45.23 
 
 
397 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  46.32 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  51.17 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  50.91 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  44.33 
 
 
426 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  49.87 
 
 
384 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  49.22 
 
 
404 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  49.87 
 
 
425 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  47.45 
 
 
419 aa  289  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  43.15 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  46.3 
 
 
408 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.41 
 
 
539 aa  278  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.97 
 
 
397 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  48.26 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  47.77 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  46.44 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
479 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  36.8 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  48.15 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  38.81 
 
 
429 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  41.67 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
563 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  41.67 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  41.67 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
517 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  43.3 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.33 
 
 
558 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
494 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
515 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  42.67 
 
 
547 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.87 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  33.83 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.91 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  44.29 
 
 
478 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  29.48 
 
 
418 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  39.56 
 
 
395 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  39.02 
 
 
558 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.15 
 
 
480 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  30.97 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
532 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  42.5 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.29 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
552 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 
387 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  47.37 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  36.08 
 
 
407 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.37 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  31.71 
 
 
538 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  38.89 
 
 
525 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 
399 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  20.08 
 
 
381 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  39.36 
 
 
430 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 
529 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 
493 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.36 
 
 
540 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  48.78 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.57 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  25.19 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  44.68 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 
514 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.14 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  29.07 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
526 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 
501 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  28.69 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.99 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  30.36 
 
 
434 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  41.3 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  48.84 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  40 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  34.72 
 
 
562 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>