167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1467 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 408 aa  790    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  59.74 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  51.85 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  49.47 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  51.56 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  47.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  41.14 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 421 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  32.12 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  34.22 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  31.5 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  31.36 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.65 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.12 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  47.3 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  27.81 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  30.15 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.28 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.88 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  40.48 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 558 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  29.86 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  29.94 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  40 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.52 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.38 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  24.28 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  26.7 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 528 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  29.78 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  47.06 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 478 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  46.15 
 
 		 645 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  30.99 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  42.5 
 
 		 627 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  31.37 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  27.14 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  25.25 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  47.22 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.66 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  27.84 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  36.63 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 515 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  37.1 
 
 		 555 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  27.25 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 543 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  41.94 
 
 		 515 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  38.71 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 312 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  27.38 
 
 		 326 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.44 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  39.06 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  27.99 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  55.56 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 665 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  35.11 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  39 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  32.81 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.32 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  40.85 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  32.81 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  32.81 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  34.55 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.86 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  39.29 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  39.29 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.07 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 485 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  26.3 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  41.89 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>