93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0193 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  829    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  50.99 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  40.21 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  41.85 
 
 		 495 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  44.73 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  39.55 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  37.84 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.11 
 
 		 411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 429 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  37.87 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  37.92 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.88 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  38.11 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  32.73 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  32.79 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  31.79 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  38.18 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.42 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  28.75 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  34.52 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.59 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.41 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  32.92 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  30.99 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  30.65 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.77 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  26.35 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.67 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  37.72 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  26.81 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.76 
 
 		 525 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  31.67 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  42.37 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  42.37 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  42.37 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  37.93 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  23.92 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.62 
 
 		 740 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  25.96 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  31.94 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  38.82 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.03 
 
 		 614 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  34.27 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  24.84 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 600 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  26.78 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 558 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  28.38 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  34.65 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.86 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  32.76 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  32.76 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  31.91 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.29 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  42.62 
 
 		 598 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  30.96 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.1 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  36.45 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  40 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  41.82 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  35.29 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  31.1 
 
 		 520 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  32.69 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  30.18 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.21 
 
 		 537 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  27.43 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>