40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2662 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 376 aa  742    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  27.89 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  29.66 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  30.42 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.74 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  27.07 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  29.02 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  26.74 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  49.12 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  46.67 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  27.3 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  31.76 
 
 		 420 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.83 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.9 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  31.58 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  19.31 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  43.1 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26290  sugar diacid utilization regulator  40.74 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.687043  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  43.33 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  43.33 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  43.33 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  45.83 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 514 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>