150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1029 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  61.68 
 
 		 534 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  100 
 
 		 536 aa  1049    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  81.38 
 
 		 566 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  68.38 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 546 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  59.17 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  52.23 
 
 		 596 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 586 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  53.69 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  41.86 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  38.22 
 
 		 532 aa  299  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.85 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.83 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  40.42 
 
 		 523 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.34 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.04 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.12 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.82 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  23.78 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.14 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.88 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  37.28 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.59 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.56 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.75 
 
 		 538 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  37.64 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.95 
 
 		 519 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 609 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.73 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  27.82 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.66 
 
 		 525 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  25.96 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  36.13 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  36.7 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  37.96 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.42 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.52 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.41 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  27.29 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  23.95 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.82 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.43 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.66 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  25.56 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.33 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.68 
 
 		 740 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  35 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.56 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  34.4 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.24 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.66 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 494 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.45 
 
 		 410 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.06 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.09 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  28.89 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  28.68 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.14 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  30 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.61 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.61 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.63 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  26.26 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.61 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.61 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.61 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.61 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.26 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.13 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.17 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.45 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  28.24 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.82 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  26.55 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  24.6 
 
 		 618 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  27.7 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>