115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4079 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 523 aa  953    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 535 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.01 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  40.8 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  37.55 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  38.94 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  40.71 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  36.33 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  39.22 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.69 
 
 		 533 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  38.66 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.21 
 
 		 596 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  36.45 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  35.02 
 
 		 543 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 557 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  45.4 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.75 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 549 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  41.1 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  46.2 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 235 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  43.2 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 542 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.52 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.06 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  42.64 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.42 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.62 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.9 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.56 
 
 		 555 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.36 
 
 		 609 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.94 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.77 
 
 		 619 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.57 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  35.33 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.96 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.6 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.89 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.89 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  36.65 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.84 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  41.22 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  32.39 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.06 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.14 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  29.24 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  37.74 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  34.53 
 
 		 665 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  37.76 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.38 
 
 		 648 aa  53.5  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  33.06 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.16 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.29 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.96 
 
 		 585 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 563 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  37.88 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  38 
 
 		 434 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.2 
 
 		 637 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.13 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  29.74 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  25.68 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.07 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 740 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.74 
 
 		 543 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  36.55 
 
 		 456 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  31.8 
 
 		 614 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  27.86 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  27.86 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  27.86 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>