189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0740 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  94.74 
 
 		 399 aa  767    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  801    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  24.15 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  23 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  22.52 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.52 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.52 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  22.76 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  22.76 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.76 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  21.03 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  31.15 
 
 		 555 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.03 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.54 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 564 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.19 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  25.47 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  30.97 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  26.79 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 563 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.34 
 
 		 740 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.28 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.17 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.37 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  25.89 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.03 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  29.84 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.93 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  24.78 
 
 		 645 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  27.34 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  23.33 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  25 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  20.37 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  27.56 
 
 		 705 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  29.84 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.33 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  22.46 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  30.86 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.47 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  31.2 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.61 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  23.08 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  21.16 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.24 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  19.64 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.35 
 
 		 602 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  19.75 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 517 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.71 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.81 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  23.16 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  24.24 
 
 		 558 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  23.17 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 516 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 563 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  25.4 
 
 		 311 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 562 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.13 
 
 		 459 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.67 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  24.55 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.45 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  33.33 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.45 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.45 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 557 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  29.03 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.4 
 
 		 519 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.57 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  29.91 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 520 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  25.66 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  17.74 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>