99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2197 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 540 aa  1114    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.84 
 
 		 555 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.92 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.5 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.3 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.35 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1492  hypothetical protein  31.87 
 
 		 115 aa  56.2  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  37.68 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  37.31 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  39.24 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  39.24 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 397 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  39.24 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.53 
 
 		 518 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.09 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  38.57 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  30.33 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  33.73 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  37.31 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  38.81 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  37.31 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 374 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  36.59 
 
 		 407 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  36.21 
 
 		 150 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  30.7 
 
 		 380 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  35.82 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  27.05 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  24.31 
 
 		 598 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  27.56 
 
 		 536 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  31.34 
 
 		 393 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 561 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 536 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  35.82 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  32.86 
 
 		 397 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  27.5 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  37.14 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  34.52 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  38.78 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  33.33 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.72 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  31.58 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  29.85 
 
 		 392 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  33.85 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  31.51 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  31.75 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  27.78 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  36.25 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  31.43 
 
 		 400 aa  45.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  39.22 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  32.35 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  42.59 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 609 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 514 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.15 
 
 		 739 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.33 
 
 		 384 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 403 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 586 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  34.48 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  32.76 
 
 		 383 aa  43.5  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  34.25 
 
 		 379 aa  43.5  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>