102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4484 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 365 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  44.13 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  39.19 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  40.17 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  37.63 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  32.75 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  29.79 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  40.2 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  26.54 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  27.44 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  54.39 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.75 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  27.74 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  27.03 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  27.03 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  27.03 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  27.82 
 
 		 554 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  27.82 
 
 		 554 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  27.82 
 
 		 554 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.55 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.47 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.47 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 517 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  25.33 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.56 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  19 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  26.5 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  59.57 
 
 		 549 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  27.41 
 
 		 522 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 558 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  45.61 
 
 		 539 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 525 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  28.46 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 479 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 514 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  53.7 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  42.86 
 
 		 525 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  48.28 
 
 		 525 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  38.33 
 
 		 555 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  33.55 
 
 		 538 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  28.09 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  43.86 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  33.87 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  33.87 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 532 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  24.84 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 504 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  47.14 
 
 		 524 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  23.33 
 
 		 538 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 		 739 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 553 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  39.66 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  31.69 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  36.43 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  41.54 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  29.14 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  23.83 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  38.33 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.27 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  25.97 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 460 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  48.33 
 
 		 519 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  33.82 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.66 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  47.06 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  40.3 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 659 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  48.89 
 
 		 543 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>