54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4011 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  87.19 
 
 		 406 aa  695    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  100 
 
 		 406 aa  811    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  47.57 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.05 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  28.26 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  27.18 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  39.81 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  37 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  39.29 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35.2 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.4 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  21.31 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  19.21 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  38.14 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  33.01 
 
 		 530 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.84 
 
 		 538 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  25.81 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  25.81 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  25.81 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.32 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 558 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.08 
 
 		 537 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  27.18 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  27.2 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  29.05 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.37 
 
 		 740 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  28.97 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  30.1 
 
 		 529 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  29.09 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.66 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 705 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  40 
 
 		 524 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  29.11 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  41.18 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  27.88 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  28.15 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  30.93 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 739 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>