46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6844 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  100 
 
 		 394 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  47.96 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  43.44 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  41.31 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  41.58 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  39.9 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  40.2 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  28.79 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  29.46 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  33.18 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  29.15 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.8 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  28.38 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.79 
 
 		 740 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.07 
 
 		 648 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  29.39 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  34.74 
 
 		 644 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  31.37 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  24.27 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  37.78 
 
 		 619 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  37.5 
 
 		 645 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.3 
 
 		 520 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 558 aa  46.2  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.5 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.31 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  35.79 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  32.23 
 
 		 618 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  35.65 
 
 		 538 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 526 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.46 
 
 		 739 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  29.81 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  26.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 494 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 665 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  32.41 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>