44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3869 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 405 aa  804    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  56.37 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  51.63 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  46.27 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  45.16 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  44.25 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  40.2 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  36.03 
 
 		 417 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  29.54 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  31.46 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.97 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  39.86 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  29.94 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  26.65 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.31 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  32.89 
 
 		 525 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.84 
 
 		 648 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.19 
 
 		 618 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  20 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  28.83 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  18 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.53 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  34.48 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  33.65 
 
 		 644 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  27.65 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  29 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.22 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  28.35 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.83 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  31.97 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 739 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.9 
 
 		 520 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  24.81 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 552 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>