82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4444 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 438 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  31.14 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  31 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  33.92 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  36.13 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  33.86 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  32.09 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  30.19 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  26.32 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  30.23 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  30.95 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  26.74 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  28.43 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  30.86 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  35.94 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  39.67 
 
 		 538 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 532 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.93 
 
 		 740 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  34.48 
 
 		 618 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  32.24 
 
 		 645 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  27.11 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  35.29 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  42.11 
 
 		 536 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  34.04 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.06 
 
 		 705 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 531 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 552 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  32.62 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  34.06 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  34.06 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  34.06 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  37.1 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  40.79 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  38.54 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.62 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  43.86 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  37.89 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.64 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.62 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  47.27 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.86 
 
 		 601 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  36.5 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.62 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  36.22 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  40.79 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.21 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  41.43 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  30.36 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.27 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 515 aa  43.5  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 558 aa  43.1  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.18 
 
 		 493 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>