33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4213 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  28.01 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  28.48 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  27.12 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  27.36 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  26.42 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  27.15 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  31.02 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  25.59 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  28.04 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  35.23 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  30.5 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  35.25 
 
 		 422 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  43.02 
 
 		 519 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 537 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  34.19 
 
 		 618 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  29.17 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 609 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  52 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 563 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  30.77 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  25.98 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  31.93 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  40.24 
 
 		 504 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  35.8 
 
 		 328 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>