44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12395 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  874    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  69.68 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  63.7 
 
 		 421 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  45.67 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  44.25 
 
 		 405 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  41.58 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  37 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  41.65 
 
 		 406 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  31.14 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  26.64 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  27.02 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  26.13 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  26.82 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  24.64 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  29.45 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  29.46 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  28.36 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  27.07 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  24.79 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  26.32 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 305 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.06 
 
 		 518 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.15 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  24.32 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  27.13 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  29.41 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.91 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  22.97 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  24.48 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  25.77 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 552 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>