38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11481 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  100 
 
 		 432 aa  873    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  69.68 
 
 		 437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  63.46 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  45.16 
 
 		 405 aa  315  9e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  44.81 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  41.31 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  37.44 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  39.55 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  29.15 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.59 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  28.48 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  29.53 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  24.21 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  29.77 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.96 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  30.39 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.15 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  25.48 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.13 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  25.08 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.21 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  36.59 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  27.56 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  25.2 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  29.06 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  26.17 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  27.62 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  28.95 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  27.06 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  28.91 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  30.97 
 
 		 520 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  23.94 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>