32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2140 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2140  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 411 aa  816    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  23.6 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 518 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  48.94 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 296 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.04 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  36.67 
 
 		 362 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  24.17 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  24.17 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  42.59 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.79 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  43.14 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.79 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.5 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.95 
 
 		 505 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  28.45 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  45.95 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  27.35 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26290  sugar diacid utilization regulator  38.46 
 
 		 360 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.687043  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  23.84 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>