22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3307 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.468406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  34.09 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  29.97 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  38.03 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.18 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  30.83 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2070  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  29.01 
 
 		 619 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.76 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.04 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  37.04 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.39 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>