203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0029 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0029  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 855 aa  1618    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0035  XRE family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 853 aa  1241    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.23 
 
 		 816 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 901 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.44 
 
 		 1103 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 781 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.51 
 
 		 1125 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 910 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 1100 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 799 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.51 
 
 		 1058 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 886 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.77 
 
 		 779 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  32.92 
 
 		 824 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.45 
 
 		 1066 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.56 
 
 		 1102 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 775 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  29.14 
 
 		 1087 aa  134  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  33.4 
 
 		 1119 aa  134  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.44 
 
 		 1097 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 768 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 1092 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.66 
 
 		 1042 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.13 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.2 
 
 		 1085 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 972 aa  129  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.69 
 
 		 1050 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 818 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  31.06 
 
 		 840 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  31.2 
 
 		 792 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.77 
 
 		 999 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.31 
 
 		 960 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 1227 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  30.89 
 
 		 799 aa  124  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 736 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 618 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 1082 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32 
 
 		 1055 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  30.72 
 
 		 1049 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  28.5 
 
 		 776 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 1058 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  31.79 
 
 		 1076 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 1137 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  30.85 
 
 		 907 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 804 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.63 
 
 		 982 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  31.98 
 
 		 1056 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 948 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 887 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 1043 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  25.34 
 
 		 888 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 872 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 973 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.49 
 
 		 916 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 831 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 1085 aa  111  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 1141 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.82 
 
 		 1110 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 802 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 1014 aa  111  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 755 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 812 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 973 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 1093 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 961 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 959 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 950 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 948 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  32.13 
 
 		 1072 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.02 
 
 		 906 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 969 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 		 1010 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 882 aa  105  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 877 aa  104  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 931 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  30.38 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 954 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 973 aa  103  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  31.96 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.17 
 
 		 1064 aa  101  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  28.77 
 
 		 953 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 966 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 928 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  29.4 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 1079 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 1161 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 601 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.15 
 
 		 975 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 765 aa  98.6  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  27.74 
 
 		 701 aa  98.6  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 1027 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  31.27 
 
 		 1131 aa  98.6  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 1158 aa  97.8  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  31.61 
 
 		 1060 aa  97.8  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.69 
 
 		 1005 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 1036 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 481 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.61 
 
 		 957 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 1060 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>