92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2039 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  46.59 
 
 		 949 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 955 aa  1944    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  27.97 
 
 		 734 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  30.62 
 
 		 801 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  26.92 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  26.31 
 
 		 734 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  29.12 
 
 		 826 aa  177  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  30.2 
 
 		 839 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  28.18 
 
 		 775 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  27.42 
 
 		 793 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  27.26 
 
 		 796 aa  163  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  26.97 
 
 		 796 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  25.65 
 
 		 819 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.46 
 
 		 1187 aa  145  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.78 
 
 		 787 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  29.14 
 
 		 1188 aa  144  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 793 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  30.67 
 
 		 1118 aa  138  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  28.92 
 
 		 883 aa  129  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.06 
 
 		 805 aa  128  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  25.84 
 
 		 936 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.86 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  27.83 
 
 		 856 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 770 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  28.02 
 
 		 831 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  27.16 
 
 		 836 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  23.84 
 
 		 553 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 		 831 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 585 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  24.08 
 
 		 897 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.48 
 
 		 910 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  24.95 
 
 		 661 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  24.38 
 
 		 1107 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  22.36 
 
 		 910 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  25.09 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.31 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.05 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  25.22 
 
 		 774 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  26.38 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  22.1 
 
 		 894 aa  79.3  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  20.88 
 
 		 923 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  24.45 
 
 		 910 aa  75.5  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  23.61 
 
 		 1061 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  24.55 
 
 		 829 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  25.67 
 
 		 844 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  33.85 
 
 		 935 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  24.1 
 
 		 931 aa  72.8  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.09 
 
 		 941 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  24.67 
 
 		 855 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  18.82 
 
 		 926 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  24.75 
 
 		 941 aa  71.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  24.73 
 
 		 971 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.06 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  20.42 
 
 		 916 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  23.66 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  22.33 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.21 
 
 		 1507 aa  64.7  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  20.58 
 
 		 909 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  23.61 
 
 		 901 aa  62.4  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  22.86 
 
 		 1084 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.79 
 
 		 895 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 		 761 aa  60.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  20.53 
 
 		 1251 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 876 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  28.57 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.84 
 
 		 1429 aa  59.3  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.05 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  21.33 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.52 
 
 		 882 aa  57.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  23.43 
 
 		 880 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  20.18 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1216  hypothetical protein  24.02 
 
 		 585 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  20.29 
 
 		 918 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  25.54 
 
 		 776 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  30.07 
 
 		 860 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.57 
 
 		 676 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  27.89 
 
 		 776 aa  54.7  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.22 
 
 		 676 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  22.74 
 
 		 899 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  30.07 
 
 		 860 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  29.37 
 
 		 860 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  22.26 
 
 		 773 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  28.67 
 
 		 860 aa  51.2  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.21 
 
 		 834 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  26.09 
 
 		 951 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.95 
 
 		 878 aa  45.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>