More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0757 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  100 
 
 		 799 aa  1592    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  44.79 
 
 		 840 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  43.31 
 
 		 824 aa  572  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  44.99 
 
 		 886 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.65 
 
 		 827 aa  379  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.47 
 
 		 792 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.33 
 
 		 999 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.36 
 
 		 1085 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.93 
 
 		 1125 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 781 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 775 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.55 
 
 		 1119 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.07 
 
 		 1092 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 1137 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.45 
 
 		 1087 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.42 
 
 		 1056 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 768 aa  301  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.55 
 
 		 1102 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 1227 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.13 
 
 		 816 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 1066 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.33 
 
 		 1050 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.37 
 
 		 814 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.33 
 
 		 701 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.64 
 
 		 1103 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 882 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  42 
 
 		 1042 aa  281  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.24 
 
 		 1017 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.92 
 
 		 1055 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.99 
 
 		 960 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 1085 aa  274  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  43.34 
 
 		 1043 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.55 
 
 		 840 aa  270  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 1058 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 1093 aa  267  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.27 
 
 		 760 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 1049 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.38 
 
 		 1097 aa  264  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 887 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.48 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 765 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 952 aa  255  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 957 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.6 
 
 		 1058 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 972 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.69 
 
 		 1072 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 921 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 1094 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  42.79 
 
 		 1036 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.73 
 
 		 1060 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 950 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.21 
 
 		 1100 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35.14 
 
 		 780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 901 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 393 aa  243  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.97 
 
 		 1110 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 969 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.75 
 
 		 916 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.84 
 
 		 975 aa  238  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.71 
 
 		 678 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 1082 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 799 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 831 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.55 
 
 		 776 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 910 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 658 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  44.71 
 
 		 1158 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.87 
 
 		 1010 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 812 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 		 779 aa  224  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 1001 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 973 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 1018 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  36.33 
 
 		 982 aa  222  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.85 
 
 		 943 aa  222  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 928 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 973 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  36.85 
 
 		 907 aa  220  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 973 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 966 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 		 961 aa  215  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 888 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 877 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 948 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1141 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 1048 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 726 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 931 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 601 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.59 
 
 		 948 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 1005 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 953 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.52 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  40.9 
 
 		 922 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.18 
 
 		 1131 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>