More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10909 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  56.11 
 
 		 1085 aa  873    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 1085 aa  820    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 882 aa  1767    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  65.16 
 
 		 887 aa  1035    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 1137 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 393 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.19 
 
 		 1119 aa  300  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  44.79 
 
 		 886 aa  300  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 781 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38.67 
 
 		 701 aa  287  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.92 
 
 		 792 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.66 
 
 		 1092 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.6 
 
 		 1087 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.65 
 
 		 1125 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 775 aa  269  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.27 
 
 		 960 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42 
 
 		 1066 aa  264  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.17 
 
 		 969 aa  264  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 1227 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.5 
 
 		 824 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.58 
 
 		 1050 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.1 
 
 		 1017 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37 
 
 		 799 aa  259  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 952 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.73 
 
 		 999 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  42.3 
 
 		 957 aa  253  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 1097 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.91 
 
 		 1055 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.47 
 
 		 1056 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.76 
 
 		 916 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 755 aa  244  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.88 
 
 		 1103 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 1042 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 919 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.08 
 
 		 1102 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 814 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  34.73 
 
 		 816 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 1058 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 768 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  41.51 
 
 		 921 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 		 1094 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.68 
 
 		 950 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.34 
 
 		 678 aa  233  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.12 
 
 		 840 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 1049 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.52 
 
 		 760 aa  231  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 877 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.72 
 
 		 1072 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.85 
 
 		 1110 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 972 aa  227  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 1058 aa  227  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 1100 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 1001 aa  225  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.38 
 
 		 776 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 736 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 901 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 818 aa  217  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 591 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.05 
 
 		 1010 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 1141 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 591 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.85 
 
 		 827 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 1005 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1043 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.83 
 
 		 780 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.85 
 
 		 1060 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 931 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  42.46 
 
 		 948 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 973 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 601 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.41 
 
 		 777 aa  209  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 943 aa  208  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 973 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 966 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.27 
 
 		 973 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 658 aa  206  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 948 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 953 aa  206  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.1 
 
 		 1036 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 1093 aa  204  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 928 aa  204  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  37.81 
 
 		 906 aa  204  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  33.79 
 
 		 907 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 975 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  36.1 
 
 		 982 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 959 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.61 
 
 		 1056 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  32.4 
 
 		 956 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  37.79 
 
 		 1014 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 812 aa  197  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.57 
 
 		 1018 aa  197  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  38.92 
 
 		 951 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 618 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 910 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 726 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 980 aa  193  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.99 
 
 		 961 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>