More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6636 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 992 aa  2002    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  39.94 
 
 		 994 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1086 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1006 aa  546  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1027 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1010 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 999 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1161 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1006 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 1043 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 982 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1117 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1023 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1124 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 1140 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  33.13 
 
 		 925 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 994 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1079 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1008 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1181 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1155 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1000 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1028 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1120 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1119 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 986 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1114 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 1026 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1062 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1058 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1037 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 997 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 996 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1097 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1148 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1128 aa  403  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1034 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 989 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1071 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1158 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1137 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1050 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1029 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1038 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1012 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1177 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1164 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1129 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1062 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1152 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1079 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.93 
 
 		 1024 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.62 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1137 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1024 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1028 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1017 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1064 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  30.5 
 
 		 1017 aa  379  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1173 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1147 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1062 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1040 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1122 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1096 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1109 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1071 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1041 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 1128 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1160 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1053 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1071 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1132 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1060 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1020 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1082 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 1023 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1013 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1172 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1161 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1006 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1085 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 1041 aa  364  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1154 aa  363  6e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 979 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1019 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1081 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1051 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1003 aa  361  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1154 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1018 aa  360  9e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1026 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1023 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>