158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5230 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1222 aa  2485    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  45.69 
 
 		 938 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1313 aa  172  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  27.35 
 
 		 797 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1245 aa  142  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1488 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  40.52 
 
 		 1140 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.92 
 
 		 4071 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.96 
 
 		 885 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.29 
 
 		 561 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2833 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1064 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  29.48 
 
 		 873 aa  115  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.97 
 
 		 3682 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1287 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  31.49 
 
 		 496 aa  111  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  25.31 
 
 		 541 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25.8 
 
 		 890 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  30.81 
 
 		 636 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1547 aa  98.2  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1163 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.93 
 
 		 1230 aa  95.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29 
 
 		 490 aa  95.1  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.87 
 
 		 662 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  24.86 
 
 		 1620 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.71 
 
 		 822 aa  92.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.44 
 
 		 540 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  28.43 
 
 		 886 aa  91.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  22.71 
 
 		 3851 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.17 
 
 		 2402 aa  88.6  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  31.89 
 
 		 742 aa  88.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.62 
 
 		 794 aa  84.7  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  40.45 
 
 		 3542 aa  84.7  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.67 
 
 		 792 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.54 
 
 		 1463 aa  84.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.42 
 
 		 2713 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  35.1 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  39.56 
 
 		 2980 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.12 
 
 		 1657 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  37.29 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  25.67 
 
 		 534 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.64 
 
 		 429 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  40 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  29.75 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  40.66 
 
 		 2972 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  24.89 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.69 
 
 		 532 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.83 
 
 		 2270 aa  76.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  33.06 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  25.22 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 658 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  31.51 
 
 		 652 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.9 
 
 		 808 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  28.42 
 
 		 2262 aa  73.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  23.47 
 
 		 967 aa  72.8  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.33 
 
 		 627 aa  72  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.65 
 
 		 1466 aa  71.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  24.49 
 
 		 749 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.15 
 
 		 1606 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.17 
 
 		 1152 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.58 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  27.27 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  32.74 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.96 
 
 		 1602 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.14 
 
 		 4429 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  24 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  23.51 
 
 		 1345 aa  65.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.2 
 
 		 989 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.67 
 
 		 1288 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  23.91 
 
 		 657 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.15 
 
 		 6497 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  25.94 
 
 		 5298 aa  64.3  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1139 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.92 
 
 		 1748 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.53 
 
 		 1162 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.08 
 
 		 991 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.75 
 
 		 3793 aa  62.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.3 
 
 		 1266 aa  62  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  39.51 
 
 		 640 aa  62  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 1389 aa  61.6  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1804 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.76 
 
 		 1371 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1259 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  37.8 
 
 		 637 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.25 
 
 		 3227 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2421 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  23.99 
 
 		 2454 aa  58.9  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.73 
 
 		 2807 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2411 aa  58.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  30.71 
 
 		 3737 aa  58.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2367 aa  58.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  22.26 
 
 		 689 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1329 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  24.74 
 
 		 774 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  31.63 
 
 		 969 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  31.63 
 
 		 963 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1228 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  29.84 
 
 		 950 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 815 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1634 aa  56.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>