More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3591 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 730 aa  1499    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  40.88 
 
 		 716 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  37.6 
 
 		 719 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  28.35 
 
 		 740 aa  229  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 753 aa  97.8  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 789 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 806 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.85 
 
 		 827 aa  90.5  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 793 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 1045 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  28.88 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 831 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 872 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 833 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 1041 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  29.11 
 
 		 888 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 793 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 988 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1089 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  24.71 
 
 		 821 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1016 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1059 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  22.38 
 
 		 800 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 814 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1096 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1038 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1077 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1033 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  21.9 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 		 1123 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1058 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 1028 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 958 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 874 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 1035 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 935 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1031 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 986 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 1034 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 999 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1019 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1013 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1169 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1083 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 923 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 786 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 996 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1165 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 902 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1043 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.01 
 
 		 1025 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1004 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1059 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 772 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.77 
 
 		 833 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1059 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.89 
 
 		 917 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1008 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1034 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.41 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 1090 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 1005 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 929 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 1008 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1144 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 1010 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1079 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1070 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.24 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 991 aa  60.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 1080 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1102 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1138 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  27.14 
 
 		 979 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1063 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.6 
 
 		 942 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1033 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1010 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 1237 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1148 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1124 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  29.66 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1177 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1011 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 923 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>