112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2472 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  39.63 
 
 		 1161 aa  750    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  41.27 
 
 		 1113 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  39.12 
 
 		 1208 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  38.96 
 
 		 1166 aa  744    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  60.84 
 
 		 1127 aa  1398    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  39.12 
 
 		 1183 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  42.13 
 
 		 1098 aa  802    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  46.61 
 
 		 1109 aa  939    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  39.42 
 
 		 1203 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  43.65 
 
 		 1126 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  38.31 
 
 		 1098 aa  704    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.07 
 
 		 1120 aa  726    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1172 aa  2414    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  43.34 
 
 		 1088 aa  865    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  45.78 
 
 		 1129 aa  970    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  37.28 
 
 		 1107 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.19 
 
 		 1114 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.08 
 
 		 1236 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.41 
 
 		 1228 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.3 
 
 		 1246 aa  505  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.92 
 
 		 1193 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.1 
 
 		 1226 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.36 
 
 		 1208 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.1 
 
 		 1170 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.81 
 
 		 1192 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.82 
 
 		 1225 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.24 
 
 		 1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  30.03 
 
 		 573 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.31 
 
 		 593 aa  170  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.45 
 
 		 1066 aa  168  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.19 
 
 		 596 aa  167  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.65 
 
 		 604 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.06 
 
 		 556 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.45 
 
 		 583 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.94 
 
 		 574 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.48 
 
 		 600 aa  151  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.56 
 
 		 546 aa  150  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.22 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.22 
 
 		 585 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.67 
 
 		 649 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.3 
 
 		 604 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.93 
 
 		 577 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.45 
 
 		 562 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.11 
 
 		 566 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.27 
 
 		 951 aa  118  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.67 
 
 		 737 aa  112  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.8 
 
 		 569 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  24.75 
 
 		 803 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.18 
 
 		 554 aa  99.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1127 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.35 
 
 		 573 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  26.42 
 
 		 730 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.06 
 
 		 645 aa  88.2  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.6 
 
 		 1040 aa  87.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.96 
 
 		 668 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.85 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.13 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.47 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.71 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.08 
 
 		 574 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.39 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  34.13 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.37 
 
 		 655 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.49 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.92 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.37 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.44 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1575 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  25.23 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.17 
 
 		 658 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.4 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  26.23 
 
 		 1346 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  21.61 
 
 		 620 aa  62  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  24.89 
 
 		 664 aa  61.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  21.9 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  27.24 
 
 		 681 aa  56.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.16 
 
 		 455 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25 
 
 		 1490 aa  56.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  30.72 
 
 		 590 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  26.32 
 
 		 1337 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.12 
 
 		 974 aa  55.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.19 
 
 		 1348 aa  55.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  21.89 
 
 		 657 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.81 
 
 		 8871 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.54 
 
 		 510 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.79 
 
 		 1113 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  25.19 
 
 		 523 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.24 
 
 		 1124 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.89 
 
 		 1126 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.32 
 
 		 645 aa  50.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.65 
 
 		 1838 aa  50.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.69 
 
 		 499 aa  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.79 
 
 		 1340 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  49.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.05 
 
 		 526 aa  49.3  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  28.05 
 
 		 482 aa  48.9  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  28.14 
 
 		 506 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.51 
 
 		 404 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.29 
 
 		 447 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.01 
 
 		 828 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>