More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2946 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 781 aa  1471    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.5 
 
 		 792 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 775 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.21 
 
 		 824 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  39.36 
 
 		 999 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  43.99 
 
 		 1085 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 886 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 814 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.82 
 
 		 1087 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  47.84 
 
 		 960 aa  363  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  52.4 
 
 		 1119 aa  357  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 1085 aa  353  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.33 
 
 		 816 aa  351  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 1137 aa  341  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.26 
 
 		 701 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.17 
 
 		 1092 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 		 765 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 768 aa  334  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.15 
 
 		 776 aa  333  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37.17 
 
 		 799 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 1100 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  43.18 
 
 		 1102 aa  330  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  47.02 
 
 		 1066 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 882 aa  328  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.17 
 
 		 1056 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  41.11 
 
 		 1103 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.67 
 
 		 1125 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  47.6 
 
 		 887 aa  321  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  45.14 
 
 		 1058 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.54 
 
 		 1050 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 1049 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 1042 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.03 
 
 		 1017 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  43.47 
 
 		 1055 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 1227 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 1097 aa  298  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  43.96 
 
 		 1058 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.33 
 
 		 957 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 952 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 799 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  42.95 
 
 		 818 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 901 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 1043 aa  290  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.71 
 
 		 780 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 972 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.69 
 
 		 1110 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  47.5 
 
 		 1036 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  42.55 
 
 		 921 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.49 
 
 		 827 aa  283  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.71 
 
 		 840 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 755 aa  280  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 966 aa  277  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  43.41 
 
 		 916 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 1082 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 969 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 1094 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  44.2 
 
 		 1072 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  43.2 
 
 		 1060 aa  271  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  42.33 
 
 		 950 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.71 
 
 		 760 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 910 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.97 
 
 		 877 aa  266  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  45.34 
 
 		 591 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 961 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 1010 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 		 1093 aa  262  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 943 aa  260  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 393 aa  260  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.03 
 
 		 678 aa  260  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 1001 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  43.74 
 
 		 1005 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 840 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 922 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  36.14 
 
 		 1056 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  48.36 
 
 		 1158 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 591 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  39.79 
 
 		 779 aa  250  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  48.75 
 
 		 919 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 975 aa  247  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  40.09 
 
 		 907 aa  247  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 812 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  34.17 
 
 		 982 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 872 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 831 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 931 aa  240  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 928 aa  237  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  41.93 
 
 		 1048 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  44.47 
 
 		 878 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.95 
 
 		 973 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.52 
 
 		 1104 aa  234  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 658 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  46.24 
 
 		 951 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 726 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 973 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>