257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4100 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 638 aa  1321    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  58.66 
 
 		 629 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  48.83 
 
 		 629 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  46.67 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  40.59 
 
 		 638 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  41.31 
 
 		 646 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  38.83 
 
 		 677 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 599 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 600 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 620 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 565 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 584 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 559 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 615 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 673 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 564 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 594 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 568 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 593 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 540 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 617 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 625 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.3 
 
 		 666 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 623 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 587 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 615 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 630 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 636 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 631 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  21.81 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  32.18 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  22.85 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.44 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  34.25 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 479 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  21.03 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.46 
 
 		 487 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 603 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  40.91 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 527 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.83 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  35.14 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 448 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  41.86 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  39.78 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  23.43 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  21.12 
 
 		 618 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>