250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4955 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 957 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  39.64 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  40.45 
 
 		 1021 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  40 
 
 		 1733 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 654 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.32 
 
 		 950 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 621 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 453 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 965 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.94 
 
 		 993 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 760 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.85 
 
 		 1022 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.25 
 
 		 921 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.43 
 
 		 969 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.72 
 
 		 1088 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  36.02 
 
 		 1114 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  38.78 
 
 		 971 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 1014 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 921 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 1003 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.03 
 
 		 960 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.69 
 
 		 1123 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 1013 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.77 
 
 		 981 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 931 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 1093 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.09 
 
 		 1092 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  36.3 
 
 		 1090 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 990 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 983 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 1003 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  36.93 
 
 		 1118 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 		 940 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  38.37 
 
 		 611 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.02 
 
 		 1048 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 622 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 		 1100 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.41 
 
 		 1056 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.46 
 
 		 496 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1158 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 1108 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.96 
 
 		 1020 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 962 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  37.75 
 
 		 1699 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.07 
 
 		 1055 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 535 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.26 
 
 		 1125 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  33.08 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1030 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.4 
 
 		 1103 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  36.74 
 
 		 489 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.68 
 
 		 631 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 934 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.65 
 
 		 992 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 1110 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  34.12 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.39 
 
 		 981 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  37.11 
 
 		 1123 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 996 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 655 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 952 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.74 
 
 		 1025 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  35.14 
 
 		 1121 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 970 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.01 
 
 		 1097 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 990 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 1004 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 989 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 941 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.94 
 
 		 1150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 928 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 833 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 963 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1000 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 1071 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 979 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 1027 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.94 
 
 		 1339 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 1034 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 1025 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.85 
 
 		 992 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 666 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 1017 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 1186 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 1058 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 935 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 621 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 982 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>