209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3881 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 646 aa  1325    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  66.46 
 
 		 652 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 604 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 555 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 556 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 549 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 565 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.86 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 500 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  30.67 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  26.67 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 480 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  28.81 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  40 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.63 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  23.94 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 460 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 480 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  30.04 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.98 
 
 		 666 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 633 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.19 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.45 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  33.81 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  27.12 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 560 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 457 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 506 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 512 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 499 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 522 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 458 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.2 
 
 		 507 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27 
 
 		 506 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 551 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 503 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 508 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 497 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 497 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 520 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  33.09 
 
 		 540 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>