228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0242 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.42 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  31.66 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 307 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 333 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  29.06 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 254 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  19.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  19.9 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 258 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>