152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4856 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  100 
 
 		 569 aa  1180    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  47.06 
 
 		 552 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 795 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  46.06 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  39.66 
 
 		 707 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  34.61 
 
 		 423 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  35.37 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1010 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  31.98 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  64.96 
 
 		 503 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  43.07 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.14 
 
 		 411 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  37.88 
 
 		 571 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 1413 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  41.67 
 
 		 615 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.68 
 
 		 436 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.81 
 
 		 957 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.03 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.81 
 
 		 884 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 1139 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  38.64 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40.88 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  36.48 
 
 		 503 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  34.39 
 
 		 1259 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.3 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  40.15 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.45 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  34.29 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  37.78 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.59 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  38.57 
 
 		 1187 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.71 
 
 		 982 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.53 
 
 		 863 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.56 
 
 		 691 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  37.6 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.58 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.53 
 
 		 695 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.56 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.85 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  34.25 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.82 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  27.61 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.51 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.85 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.1 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.65 
 
 		 963 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.56 
 
 		 537 aa  73.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  32.14 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.65 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 		 756 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  36.29 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.87 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.17 
 
 		 794 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.32 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.85 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.17 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  25.98 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.88 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.99 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40.22 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  34.21 
 
 		 1141 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.59 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.39 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  46.15 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  45 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  46.15 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  34.35 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  34.51 
 
 		 2073 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.17 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  28.03 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  30.19 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  36.29 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.06 
 
 		 943 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  28.89 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  38.14 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  30.46 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  44.87 
 
 		 801 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  32.26 
 
 		 803 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  39.08 
 
 		 603 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.85 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  36.26 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.99 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.31 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.93 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  28.15 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  36.78 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.7 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.45 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>