236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2446 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 538 aa  1130    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  53.83 
 
 		 542 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  47.51 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 575 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  28.52 
 
 		 504 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 538 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 539 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  26.32 
 
 		 537 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  27.74 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 515 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  30.7 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 529 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 540 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 487 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.04 
 
 		 511 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  23.52 
 
 		 588 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 540 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 494 aa  90.5  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 484 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  39.85 
 
 		 534 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  21.28 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 664 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.46 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  21.89 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  21.69 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  20.92 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.93 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  22.43 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  22.14 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.22 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  32.93 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.11 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  22.88 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  21.47 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  21.7 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  21.93 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  22.28 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  22.58 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  21.23 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  21.81 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  21.98 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  22.43 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>