277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0464 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  100 
 
 
573 aa  1201    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  99.3 
 
 
573 aa  1195    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.91 
 
 
589 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 
592 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  44.44 
 
 
588 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.52 
 
 
586 aa  495  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  43.3 
 
 
591 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.97 
 
 
591 aa  485  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.8 
 
 
594 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.12 
 
 
586 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.64 
 
 
590 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  43.23 
 
 
594 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.62 
 
 
589 aa  465  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.54 
 
 
593 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.78 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  41.8 
 
 
596 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.4 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.96 
 
 
594 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.07 
 
 
592 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.78 
 
 
594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.31 
 
 
591 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.44 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  40.59 
 
 
591 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  40.59 
 
 
591 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.61 
 
 
594 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.83 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.66 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.66 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.83 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.9 
 
 
592 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.73 
 
 
592 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.73 
 
 
592 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.73 
 
 
592 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 
594 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.69 
 
 
553 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.58 
 
 
755 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.54 
 
 
522 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.9 
 
 
550 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.64 
 
 
522 aa  189  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.57 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.57 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.12 
 
 
527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.62 
 
 
526 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  29.45 
 
 
523 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.27 
 
 
527 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.62 
 
 
522 aa  177  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.12 
 
 
522 aa  174  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  30.16 
 
 
522 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.91 
 
 
528 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.24 
 
 
528 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.53 
 
 
561 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.89 
 
 
528 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.75 
 
 
522 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.62 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.77 
 
 
549 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.84 
 
 
523 aa  163  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.99 
 
 
573 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 
553 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.39 
 
 
698 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.09 
 
 
561 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 
579 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.31 
 
 
579 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 
518 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  25.97 
 
 
561 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 
573 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.29 
 
 
566 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 
579 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.67 
 
 
582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  27.1 
 
 
573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.46 
 
 
572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.7 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.4 
 
 
572 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 
563 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.51 
 
 
563 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.19 
 
 
570 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 
567 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.45 
 
 
526 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.05 
 
 
560 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.15 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.08 
 
 
581 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.25 
 
 
566 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  27.26 
 
 
574 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.17 
 
 
578 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.23 
 
 
526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  25.04 
 
 
573 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.33 
 
 
511 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.46 
 
 
556 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 
556 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.1 
 
 
570 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 
572 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  25.75 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.05 
 
 
563 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  27.66 
 
 
570 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.93 
 
 
570 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  26.18 
 
 
558 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 
569 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>