More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0027 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 413 aa  843    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  63.22 
 
 		 411 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  62.65 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  62.65 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  60.3 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  43.81 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 421 aa  298  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  39.58 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  39.44 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  37.15 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  37.93 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  41.19 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  37.17 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  38.4 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  39.03 
 
 		 436 aa  232  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 		 522 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  33.81 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 420 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  35.34 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 		 419 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  35.7 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.81 
 
 		 422 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.11 
 
 		 421 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.97 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  30.42 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  32.21 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.08 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.38 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.59 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.81 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.87 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 435 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.59 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.77 
 
 		 496 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.05 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>