157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3756 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 4071 aa  8054    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  56.38 
 
 		 2833 aa  2186    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  32.76 
 
 		 541 aa  219  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.24 
 
 		 3602 aa  218  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.96 
 
 		 2588 aa  188  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  31.39 
 
 		 496 aa  167  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1287 aa  155  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.24 
 
 		 1547 aa  137  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1488 aa  135  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.82 
 
 		 938 aa  134  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  35.36 
 
 		 1008 aa  130  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.63 
 
 		 886 aa  128  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  29.59 
 
 		 657 aa  126  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  28.92 
 
 		 1222 aa  126  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  28.97 
 
 		 648 aa  122  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.94 
 
 		 2270 aa  121  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.66 
 
 		 4978 aa  120  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  28.85 
 
 		 2344 aa  120  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  29.08 
 
 		 885 aa  116  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.41 
 
 		 1987 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  33.46 
 
 		 490 aa  114  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1313 aa  112  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  26.48 
 
 		 3851 aa  106  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1245 aa  106  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  32.91 
 
 		 581 aa  105  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  27.69 
 
 		 1140 aa  105  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.21 
 
 		 890 aa  104  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.85 
 
 		 3682 aa  101  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1634 aa  99.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  33.8 
 
 		 1108 aa  98.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  35.09 
 
 		 642 aa  97.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.64 
 
 		 1345 aa  95.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.46 
 
 		 627 aa  95.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.48 
 
 		 662 aa  92  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  28.83 
 
 		 3089 aa  91.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.51 
 
 		 989 aa  88.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.43 
 
 		 1620 aa  88.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  36.81 
 
 		 650 aa  88.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  39.18 
 
 		 532 aa  88.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.8 
 
 		 1068 aa  85.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  40.59 
 
 		 540 aa  82.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.23 
 
 		 2367 aa  82.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.23 
 
 		 2411 aa  82.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.11 
 
 		 1463 aa  82.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  41.21 
 
 		 4896 aa  82  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1163 aa  81.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.2 
 
 		 1606 aa  81.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  33.03 
 
 		 535 aa  81.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.52 
 
 		 1602 aa  79  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  24.15 
 
 		 3542 aa  79.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  44.12 
 
 		 503 aa  78.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.57 
 
 		 3227 aa  75.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  35.09 
 
 		 677 aa  74.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  41.05 
 
 		 4429 aa  73.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  32.54 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  30.3 
 
 		 1230 aa  73.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.66 
 
 		 991 aa  73.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.9 
 
 		 749 aa  72.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  29.37 
 
 		 1152 aa  72.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.86 
 
 		 1288 aa  72  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.54 
 
 		 2402 aa  72.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.9 
 
 		 3927 aa  70.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  24.8 
 
 		 815 aa  70.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.75 
 
 		 1466 aa  69.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1064 aa  69.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  35.67 
 
 		 2421 aa  69.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  37.78 
 
 		 2980 aa  69.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  27.52 
 
 		 496 aa  68.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.78 
 
 		 1371 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  38.38 
 
 		 652 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.61 
 
 		 2377 aa  68.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  26.67 
 
 		 808 aa  68.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 1389 aa  68.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.21 
 
 		 636 aa  67.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  28.82 
 
 		 946 aa  67.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.71 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  27.23 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  29.63 
 
 		 742 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1980 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  33.91 
 
 		 953 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1139 aa  66.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  28.02 
 
 		 1162 aa  66.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 3324 aa  65.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.07 
 
 		 6497 aa  65.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1976 aa  65.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.5 
 
 		 750 aa  65.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  35.16 
 
 		 429 aa  65.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.78 
 
 		 561 aa  64.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  37.7 
 
 		 2454 aa  64.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  27.27 
 
 		 774 aa  64.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  36.79 
 
 		 2972 aa  64.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.5 
 
 		 2807 aa  63.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.83 
 
 		 822 aa  62.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  34.17 
 
 		 967 aa  63.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  41.57 
 
 		 676 aa  62  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  27.39 
 
 		 998 aa  62  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  33.96 
 
 		 658 aa  61.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  37.23 
 
 		 694 aa  60.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  35.54 
 
 		 1377 aa  60.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>