179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3753 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 639 aa  1314    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  53.31 
 
 		 273 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  54.58 
 
 		 268 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  52.96 
 
 		 283 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.97 
 
 		 601 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  47.53 
 
 		 1115 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  63.91 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  62.5 
 
 		 603 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  46.15 
 
 		 552 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  53.6 
 
 		 1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  53.12 
 
 		 627 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  52.1 
 
 		 673 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  51.24 
 
 		 869 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  46.75 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 		 863 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  43.29 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  48.76 
 
 		 536 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  48.84 
 
 		 1391 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  48.41 
 
 		 389 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  47.11 
 
 		 982 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  46.97 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  44.53 
 
 		 1167 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  42.75 
 
 		 884 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  30.83 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  44.63 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  45 
 
 		 877 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  43.2 
 
 		 957 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  30.08 
 
 		 255 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1010 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  29.12 
 
 		 258 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 918 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.46 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.67 
 
 		 550 aa  97.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  38.21 
 
 		 853 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  45.13 
 
 		 461 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  40.56 
 
 		 819 aa  94  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.38 
 
 		 823 aa  93.6  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.84 
 
 		 933 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.58 
 
 		 1295 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  32.18 
 
 		 948 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.85 
 
 		 870 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1024 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.01 
 
 		 490 aa  90.5  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  38.82 
 
 		 1707 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.16 
 
 		 1356 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 802 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  41.26 
 
 		 1262 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  41.03 
 
 		 383 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  39.67 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.86 
 
 		 719 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  37.25 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  41.28 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  38.71 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 		 1380 aa  84  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  36.42 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.38 
 
 		 1321 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  41.54 
 
 		 1444 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  35.98 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  41.27 
 
 		 723 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  40.34 
 
 		 1091 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.17 
 
 		 1200 aa  80.9  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  26.69 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 840 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  35.21 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 581 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  36.17 
 
 		 928 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  35.66 
 
 		 965 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  37.43 
 
 		 1338 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.66 
 
 		 845 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 1505 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 		 777 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.69 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 1234 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.45 
 
 		 945 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  34.36 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 627 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 1122 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  37.1 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  34.78 
 
 		 1015 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 536 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 1164 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 		 1732 aa  74.7  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  29.61 
 
 		 1004 aa  74.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  39.1 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  34.9 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 780 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  28.28 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 		 1799 aa  73.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 1035 aa  73.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.42 
 
 		 1138 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  34.29 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 		 2554 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  37.8 
 
 		 524 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>