More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0043 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 1109 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  39.4 
 
 		 1093 aa  727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1099 aa  1110    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  39.9 
 
 		 1007 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  38.33 
 
 		 1011 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  37.81 
 
 		 1089 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  38.96 
 
 		 1111 aa  712    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 		 1101 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  47.65 
 
 		 1014 aa  835    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  37.72 
 
 		 1101 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  38.02 
 
 		 1119 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 1138 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1127 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  38.9 
 
 		 1080 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  37.71 
 
 		 1109 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  41.53 
 
 		 1108 aa  806    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1089 aa  2213    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  35.72 
 
 		 1113 aa  670    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  37.97 
 
 		 1102 aa  717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  39.38 
 
 		 894 aa  599  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  38.47 
 
 		 1009 aa  595  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1127 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1092 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1104 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1050 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1120 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1110 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1128 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1177 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1079 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1027 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1038 aa  367  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1122 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 1037 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1010 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1019 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1014 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1161 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1029 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1116 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1114 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1173 aa  347  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1119 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1062 aa  344  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 997 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 989 aa  343  7e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1129 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1177 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1152 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1140 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1124 aa  340  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1071 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1163 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1102 aa  337  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1097 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1079 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1181 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 982 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1154 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.65 
 
 		 1041 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1023 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1028 aa  330  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1148 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1144 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 999 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1028 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1013 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1023 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1077 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1000 aa  324  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1058 aa  324  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1146 aa  323  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 996 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1096 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1109 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1039 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1012 aa  317  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1066 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1039 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1008 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 986 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1172 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 1043 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 986 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1155 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1071 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 1154 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1128 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1051 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1106 aa  307  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1076 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1076 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1094 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 996 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1116 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1066 aa  304  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>