177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  100 
 
 		 644 aa  1248    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  45.52 
 
 		 678 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  41.78 
 
 		 649 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.54 
 
 		 701 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  37.04 
 
 		 792 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  35.18 
 
 		 776 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.35 
 
 		 960 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  42.02 
 
 		 760 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 814 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 775 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 755 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.23 
 
 		 840 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.39 
 
 		 780 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.45 
 
 		 1085 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 816 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.71 
 
 		 1102 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 1137 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 1049 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.33 
 
 		 1017 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.48 
 
 		 1056 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.83 
 
 		 777 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.56 
 
 		 1087 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.32 
 
 		 1103 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.42 
 
 		 1110 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 882 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 957 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.64 
 
 		 1119 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 1043 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 901 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 1100 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 765 aa  173  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 781 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  32.36 
 
 		 1227 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 887 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.43 
 
 		 1050 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.18 
 
 		 824 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.11 
 
 		 1018 aa  171  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.43 
 
 		 1072 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  31.34 
 
 		 1125 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 1097 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 1085 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.69 
 
 		 886 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 969 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 952 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.74 
 
 		 1058 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 768 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 943 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.81 
 
 		 999 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.77 
 
 		 1093 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.05 
 
 		 1036 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.65 
 
 		 1042 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 1161 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.87 
 
 		 1076 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.95 
 
 		 1055 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 		 1066 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.56 
 
 		 1131 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 418 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 1079 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 1100 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  33.12 
 
 		 1056 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 888 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 831 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 938 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.22 
 
 		 916 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  29 
 
 		 1092 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 878 aa  147  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1058 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.87 
 
 		 799 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 910 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 953 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 931 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 818 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 872 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 877 aa  144  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.67 
 
 		 1064 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  32.77 
 
 		 1060 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  38.17 
 
 		 1060 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.76 
 
 		 1049 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.98 
 
 		 827 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 1034 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  35.24 
 
 		 907 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.98 
 
 		 922 aa  141  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 919 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 906 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 		 1094 aa  137  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 		 1141 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 972 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.72 
 
 		 921 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 1082 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.01 
 
 		 975 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 961 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 736 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 591 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 779 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 591 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 948 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  31.29 
 
 		 943 aa  127  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 1158 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>